北京諾賽基因組研究中心(國家人類(lèi)基因組北方研究中心)、北京師范大學(xué)、中國科學(xué)院微生物研究所與美國加州大學(xué)戴維斯分校在北京師范大學(xué)就“十萬(wàn)食源性病原微生物基因組計劃”達成合作協(xié)議。據悉，中美雙方將共同參與十萬(wàn)食源性病原微生物基因組計劃的研發(fā)，建立重要的食源性致病微生物基因序列綜合數據庫，共享未來(lái)的研究成果，包括試劑盒、大樣本數據分析以及在產(chǎn)業(yè)化和商業(yè)化中的應用。

　　查找食源性病原微生物基因

　　食源性疾病是食品安全的主要問(wèn)題，世界衛生組織將食源性疾病定義為：凡是通過(guò)攝食進(jìn)入人體的，引發(fā)人體罹患感染性或中毒性的疾病，其中包括由食品微生物污染和化學(xué)性物質(zhì)引起的食源性疾病，微生物引起的食源性疾病是食品安全的主要問(wèn)題。

　　“十萬(wàn)食源性病原微生物基因組計劃”是由美國食品藥品監督局(FDA)支持，美國國家衛生院、農業(yè)部、國家疾控中心和歐盟等國家參與，加州大學(xué)戴維斯分校牽頭的一個(gè)國際基因組項目，其目標是通過(guò)大規模病原基因組研究，獲得新方法新技術(shù)，以保證對食品安全問(wèn)題提供解決方案。此項目是一個(gè)里程碑式的大規模研究，于2013年初啟動(dòng)，旨在創(chuàng )建一個(gè)包含大多數食源性致病菌基因組的公共數據庫。

　　“十萬(wàn)食源性病原微生物基因組計劃”負責人、美國加州大學(xué)戴維斯分校(UC Davis)教授Bart Weimer教授在北京接受科技日報記者采訪(fǎng)時(shí)表示，“我們正在創(chuàng )建一個(gè)免費的、在線(xiàn)的基因組百科全書(shū)或參考數據庫，以確保在食源性疾病暴發(fā)時(shí)，科學(xué)家和公共衛生專(zhuān)家可以很快確定致病微生物的種類(lèi)，并且使用自動(dòng)化信息處理方法追蹤到其在食物供應中的源頭。”

　　中美雙方將開(kāi)展多項合作

　　隨著(zhù)食品供應成為一個(gè)全球性的產(chǎn)業(yè)，食品安全已成為全球的責任，Bart Weimer教授希望通過(guò)全球的合作，為國際公共健康管理帶來(lái)一種新的模式。他說(shuō)，該項計劃還將徹底改變農業(yè)檢測中現行的一些方法，以提高對食物鏈各環(huán)節(從農場(chǎng)到餐桌)分子檢測的精確性和穩定性。

　　在中國，對于食源性致病菌的基因研究還剛剛開(kāi)始，北京諾塞基因組研究中心有限公司曾參與2003年全人類(lèi)基因組測序項目，并一直關(guān)注著(zhù)基因檢測領(lǐng)域的研究和發(fā)展趨勢。此次由該中心牽頭，聯(lián)手中國科學(xué)院微生物研究所病原微生物與免疫重點(diǎn)實(shí)驗室和北京師范大學(xué)生命科學(xué)研究院基因資源與分子發(fā)育北京市重點(diǎn)實(shí)驗室三方形成中國科學(xué)家團隊，與美國加州大學(xué)戴維斯分校Bart Weimer博士實(shí)驗室開(kāi)展合作研究，將在全球食源性致病菌基因研究中扮演積極的角色，為數據共享、市場(chǎng)開(kāi)發(fā)和技術(shù)應用提供有效的應用平臺。

　　記者了解到，在“十萬(wàn)食源性病原微生物基因組計劃”簽約項目中，中美雙方的合作包括以下七大方面：一是中美專(zhuān)家在科學(xué)和技術(shù)人員之間培訓和交流;二是“十萬(wàn)病原基因組項目”的基因組測序技術(shù)在亞洲范圍內的擴大合作;三是生物資源的交換;四是項目相關(guān)信息和生物信息學(xué)的交換;五是聯(lián)合發(fā)表科學(xué)出版物;六是爭取兩國對此合作項目聯(lián)合資助。

　　中國將建立綜合性基因數據庫

　　中美合作開(kāi)展“十萬(wàn)食源性病原微生物基因組計劃”，對于諾賽基因組研究中心的發(fā)展是一次新的機遇。北京諾賽基因組研究中心總經(jīng)理李秉珅表示，諾賽基因組研究中心最初是為了完成人類(lèi)基因組計劃而建立的，但是隨著(zhù)人類(lèi)基因組計劃的完成，諾賽研究中心的發(fā)展亟須新活力的注入，實(shí)現體制上的改革與轉變。“此次國際合作的開(kāi)展對于諾賽的未來(lái)發(fā)展意義深遠，諾賽將再前期投入500萬(wàn)元用于平臺建設和研發(fā)需要，我們也期待著(zhù)政府能夠給予項目更多的支持”，李秉坤強調。

　　在本次合作中，中國科學(xué)院微生物所的主要職責是進(jìn)行食源性病原微生物的基因測序與收集工作，同時(shí)，以高通量測序技術(shù)建立和完善生物信息分析平臺。中國科學(xué)院微生物研究所病原微生物與免疫重點(diǎn)實(shí)驗室負責人朱寶利教授稱(chēng),他們將實(shí)現對大樣本食源性病毒基因的總監控，對外公布基因測序相關(guān)數據，并且建立綜合性基因數據庫。

　　北京師范大學(xué)生命科學(xué)研究院王英典院長(cháng)告訴記者，病源性病菌基因數據庫的建立對于國家食品安全問(wèn)題的解決具有重大戰略意義。當前，中國市場(chǎng)上食品并未進(jìn)行食源性病源微生物檢測，因此，與美國合作建立病源性基因組數據庫，將為糧食安全、食品安全以及環(huán)境安全問(wèn)題提供更加有效便捷廉價(jià)的解決方案。北京師范大學(xué)將利用“基因資源與分子發(fā)育北京市重點(diǎn)實(shí)驗室”，與諾賽基因組研究中心和中科院微生物所共同建立技術(shù)平臺和功能實(shí)驗室。

　　作為北京市生物醫藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要平臺，北京生物技術(shù)和新醫藥產(chǎn)業(yè)促進(jìn)中心一直承擔著(zhù)引領(lǐng)技術(shù)創(chuàng )新，促進(jìn)國際交流和成果轉化的作用，該中心主任雷霆在闡述此次國際合作的意義時(shí)指出，中美雙方在國際化平臺上，將打破原有的研發(fā)合作模式，遵循各項法律法規，強調生物材料如微生物分離株、DNA序列及微生物綜合數字的轉移和共享，同時(shí)，對于知識產(chǎn)權將做出合理的界定，為推動(dòng)基因組測序技術(shù)推廣、學(xué)術(shù)交流和人員培訓開(kāi)展更多合作。

　　北京市科委主任閆傲霜對于“十萬(wàn)食源性病原微生物基因組計劃”的國際合作平臺的建立給予了積極肯定。她表示，目前的食品安全、土地環(huán)境污染以及農業(yè)技術(shù)的可持續發(fā)展都面臨著(zhù)嚴峻的形勢，而基因技術(shù)將為上述領(lǐng)域帶來(lái)跨越式飛躍，盡管現在應用還不很明朗，但是，未來(lái)技術(shù)產(chǎn)業(yè)化和市場(chǎng)空間前景不可預期。她說(shuō)，“北京生物醫藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展非常強調國際合作，此次與美國加州大學(xué)戴維斯分校Bart Weimer博士建立合作，將在創(chuàng )新技術(shù)、人才培養、信息資源共享以及企業(yè)成果轉化上開(kāi)辟出新的模式。

　　據了解，中美雙方關(guān)于“十萬(wàn)食源性病原微生物基因組計劃”已正式簽訂合作備忘錄，并制定了合作框架，有望于今年下半年正式開(kāi)始基因測序樣本的研發(fā)和數據庫建立。